MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 plasmid pMMC501

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009136	A	9	9	38	46	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009136	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009136	T	6	6	171	176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009136	TG	3	6	188	193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009136	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009136	A	8	8	248	255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009136	TAT	2	6	261	266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009136	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009136	T	7	7	302	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009136	AT	3	6	309	314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009136	TATAT	3	15	310	324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009136	ATT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009136	AAT	2	6	346	351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009136	TAT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009136	T	7	7	364	370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009136	A	6	6	381	386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009136	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009136	A	6	6	416	421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009136	A	7	7	427	433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009136	AAAC	2	8	449	456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009136	ATT	3	9	457	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009136	ACC	2	6	786	791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009136	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009136	AT	3	6	3430	3435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009136	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009136	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009136	TAA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009136	AAAAG	2	10	5950	5959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009136	TCTTT	2	10	5966	5975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009136	ACC	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009136	AAG	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009136	TA	5	10	6123	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009136	AT	3	6	6152	6157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009136	TTA	2	6	6199	6204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009136	AT	4	8	6637	6644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009136	TA	3	6	6664	6669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009136	ATTT	2	8	6693	6700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009136	T	7	7	6698	6704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009136	TTG	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009136	ATTC	2	8	6750	6757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009136	ATA	2	6	6800	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009136	A	8	8	6873	6880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009136	TATT	2	8	6890	6897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009136	A	7	7	6953	6959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009136	TCATTT	2	12	6997	7008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009136	ACCA	2	8	7022	7029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009136	AGA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009136	C	6	6	7090	7095	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_009136	AATA	2	8	7114	7121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009136	A	6	6	7156	7161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009136	A	6	6	7183	7188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009136	ATT	2	6	7221	7226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009136	AAT	2	6	7238	7243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009136	A	6	6	7250	7255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009136	T	7	7	7994	8000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009136	AAG	2	6	8017	8022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009136	AGA	2	6	8040	8045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009136	ATT	2	6	8088	8093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009136	T	9	9	8097	8105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009136	CAC	2	6	8108	8113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009136	AGA	2	6	8133	8138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009136	TA	3	6	8167	8172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009136	T	9	9	8190	8198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009136	ATA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.